Проблема заключалась в том, что клон не возвращает div, it returns a
фрагмент документа , using
querySelector`, как показано ниже, решает это.
const template = document.createElement("template");
template.innerHTML = `<div>supppp</div>`;
const node = template.content.cloneNode(true);
node.querySelector("div").setAttribute("style", "background-color: green;");
document.body.appendChild(node);