Основываясь на комментариях, это требует дополнительного изучения.
Тем временем вы можете использовать переменные окружения:
Создать файл .env
(имя не важно, если вы используете то же самое на следующем шаге) со следующим содержимым:
CYPRESS_numTestsKeptInMemory=3
CYPRESS_firstNumber=1000
Запустите ваши тесты в docker с:
docker run -it -v %cd%:/e2e -w /e2e --env-file .env cypress/included:3.4.0