следующее регулярное выражение преобразует всю новую строку в пустую строку и символы табуляции в пробелах
in = in.replaceAll("\\n","").replaceAll("\\t"," ");
если у вас есть другие виды пробелов, то вы можете выполнить цепочку таким же образом
РЕДАКТИРОВАТЬ
еще одна вещь, если у вас есть последовательные пробелы, то коротко replaceAll("\\s+," ");
вы можете сказать in = in.replaceAll("\\n|\\t|\\s"," ");