Я столкнулся с той же проблемой и смог восстановить список, удалив файл конфигурации в $HOME\.VirtualBox\VirtualBox.xml (Windows host)
В Linux и MacOS, путь должен быть примерно таким:
$HOME/.config/VirtualBox (Linux host)
$HOME/Library/VirtualBox (MacOS host)
Я уверен, что это не самое элегантное решение, но, похоже, его восстанавливают настройки по умолчанию без хлопот
Надеюсь, я смогу помочь, Cheers JR
Редактировать: досадно (хотя и естественно), это также сбрасывает все виды всплывающих окон и предупреждений, которые вам, возможно, придется принять снова. ..