Один из способов сделать это - установить Windows Terminal , который доступен в качестве опции оболочки в GitHub Desktop.
Затем вы можете настроить Windows Терминал для открытия WSL. В этой теме объясняется, как.
В интеграции оболочки Документация GitHub Desktop упоминает, что поддержка WSL теперь доступна в бета-версии. Кроме того, документы также объясняют, как добавить оболочку по вашему выбору, изменив код соответствующим образом.