Множество царапин на голове и отладка и, наконец, указал на проблему. Это не итерация сама по себе, а зацикливание на курсоре mongodb.
Код был records = collection.find (myquery) для записи в записях: .... зацикливание элементов записи.
Замена
records = collection.find (myquery)
с record = collection.find_one (myquery)
увеличила скорость итерации.