Мой проект имеет две версии для двух разных клиентов. Обе версии имеют несколько общих файлов с различным содержанием. Поэтому я заменил обычные файлы в war file in war, используя WebResource под плагином war. Этот файл становится каталогом в файле war, когда я запускаю maven в linux. Проект отлично работает в windows среде.