Я создал простой CLI, который поможет вам достичь этого - https://github.com/unfor19/githubsecrets
Этот CLI основан на официальном GitHub Actions Secrets API
Установить с помощью пипса
$ pip install githubsecrets
...
$ ghs --help
...
Или использовать с Docker; Вы должны предоставить все аргументы, подсказки недоступны в Docker режиме
macOS и Linux
$ docker run -v $HOME:/root unfor19/githubsecrets --help
Usage: ghs [OPTIONS] COMMAND [ARGS]...
Windows
$ docker run --rm -v c:/Temp:/root unfor19/githubsecrets --help
Usage: ghs [OPTIONS] COMMAND [ARGS]...