Не удается найти атрибут DICOM (0020,4000 [Комментарии к изображению]) - PullRequest
Новая
       88

Не удается найти атрибут DICOM (0020,4000 [Комментарии к изображению])

1 голос
/ 13 января 2020

Я пишу сценарий, использующий pydicom для автоматизации ультразвуковых медицинских отчетов.

Однако я не могу найти атрибут 0020,4000 [Комментарии к изображению]. Я пытался с разными изображениями с разных ультразвуковых аппаратов, а также с dcmdump от dcmtk безуспешно.

Любая помощь будет оценена.

Объект dicom и образец изображения приведены ниже: 

(0008, 0008) Image Type                          CS: ['ORIGINAL', 'PRIMARY', '', '0011']
(0008, 0016) SOP Class UID                       UI: Ultrasound Image Storage
(0008, 0018) SOP Instance UID                    UI: 1.2.840.113619.2.98.5380.1578912657.0.12421
(0008, 0020) Study Date                          DA: '20200113'
(0008, 0021) Series Date                         DA: '20200113'
(0008, 0023) Content Date                        DA: '20200113'
(0008, 002a) Acquisition DateTime                DT: '20200113142223.000'
(0008, 0030) Study Time                          TM: '141605'
(0008, 0031) Series Time                         TM: '141639'
(0008, 0033) Content Time                        TM: '142223'
(0008, 0050) Accession Number                    SH: '20080940/17'
(0008, 0060) Modality                            CS: 'US'
(0008, 0070) Manufacturer                        LO: 'GE Vingmed Ultrasound'
(0008, 0080) Institution Name                    LO: 'XXXXXXXXXXXXXXXXXX'
(0008, 0090) Referring Physician's Name          PN: ''
(0008, 1010) Station Name                        SH: 'VIVID7-AB'
(0008, 1030) Study Description                   LO: 'Ecocardiografia Doppler'
(0008, 1050) Performing Physician's Name         PN: 'Default'
(0008, 1070) Operators' Name                     PN: 'ADM'
(0008, 1090) Manufacturer's Model Name           LO: 'Vivid7'
(0008, 2111) Derivation Description              ST: '[EMGDCM] Lossless Compression (JPEG p14), Selection Value = 1, Point Transform = 0, compression ratio = 3.417266'
(0010, 0010) Patient's Name                      PN: 'XXXXXXXXXXXXXXXXXX'
(0010, 0020) Patient ID                          LO: 'XXXXXXXXXXXX'
(0010, 0030) Patient's Birth Date                DA: '19770609'
(0010, 0040) Patient's Sex                       CS: 'F'
(0018, 1020) Software Version(s)                 LO: 'Vivid7:4.2.0'
(0018, 6011) Sequence of Ultrasound Regions   1 item(s) ---- 
   (0018, 6012) Region Spatial Format               US: 1
   (0018, 6014) Region Data Type                    US: 2
   (0018, 6016) Region Flags                        UL: 0
   (0018, 6018) Region Location Min X0              UL: 80
   (0018, 601a) Region Location Min Y0              UL: 8
   (0018, 601c) Region Location Max X1              UL: 556
   (0018, 601e) Region Location Max Y1              UL: 391
   (0018, 6020) Reference Pixel X0                  SL: 238
   (0018, 6022) Reference Pixel Y0                  SL: -8
   (0018, 6024) Physical Units X Direction          US: 3
   (0018, 6026) Physical Units Y Direction          US: 3
   (0018, 602c) Physical Delta X                    FD: 0.04603580745589702
   (0018, 602e) Physical Delta Y                    FD: 0.04603580745589702
   (0018, 6030) Transducer Frequency                UL: 1702
   (0018, 6032) Pulse Repetition Frequency          UL: 4000

(0020, 000d) Study Instance UID                  UI: 1.2.826.0.1.3680043.2.97.1.1.1516127677.2001031016198050
(0020, 000e) Series Instance UID                 UI: 1.2.840.113619.2.98.5380.1578912657.0.12310
(0020, 0010) Study ID                            SH: '20080940/17'
(0020, 0011) Series Number                       IS: "0002"
(0020, 0013) Instance Number                     IS: "0013"
(0020, 0020) Patient Orientation                 CS: ''
(0028, 0002) Samples per Pixel                   US: 3
(0028, 0004) Photometric Interpretation          CS: 'RGB'
(0028, 0006) Planar Configuration                US: 0
(0028, 0010) Rows                                US: 434
(0028, 0011) Columns                             US: 636
(0028, 0100) Bits Allocated                      US: 8
(0028, 0101) Bits Stored                         US: 8
(0028, 0102) High Bit                            US: 7
(0028, 0103) Pixel Representation                US: 0
(0038, 0010) Admission ID                        LO: '2131087'
(0040, 0275)  Request Attributes Sequence   1 item(s) ---- 
   (0040, 0007) Scheduled Procedure Step Descriptio LO: 'Ecocardiografia Doppler'
   (0040, 0008)  Scheduled Protocol Code Sequence   1 item(s) ---- 
      (0008, 0100) Code Value                          SH: 'US'
      (0008, 0102) Coding Scheme Designator            SH: 'EXUS'
      (0008, 0104) Code Meaning                        LO: 'US'
      ---------
   (0040, 0009) Scheduled Procedure Step ID         SH: 'EXUS252375'
   (0040, 1001) Requested Procedure ID              SH: '20080940/17'
   ---------
(7fe0, 0010) Pixel Data                          OB: Array of 242300 elements

Ниже приведен пример изображения:

Sample Image

Ответы [ 2 ]

1 голос
/ 14 января 2020

Атрибут, который вы упомянули в вопросе (0020,4000 [Image Comments]), не существует в наборе данных, который вы публикуете. Таким образом, вы не можете найти его, если вы пытаетесь найти его с помощью инструментария. Кроме того, это атрибут типа 3 с набором данных, с которым вы работаете, что означает, что он является полностью необязательным.

Глядя на изображение, которое вы публикуете, я не думаю, что это то, что вы ищете. Текст на изображении не загружен из этого атрибута. Скорее всего, это часть данных пикселей или она хранится как DICOM Text Overlay в наборе данных.

0 голосов
/ 14 января 2020

Атрибут Комментарии к изображению (0020,4000) является частью Общего модуля изображений. См .: https://dicom.innolitics.com/ciods/cr-image/general-image

Модуль определяет атрибут как «Тип 3», что означает, что он может присутствовать, но также может отсутствовать. Таким образом, вы не можете полагаться на присутствующий атрибут.

Если вам просто нужно иметь изображение с присутствующим атрибутом, например, для целей тестирования, вы можете использовать редактор DICOM (так как вы используете DCMTK, dcmodify может быть инструментом по вашему выбору), чтобы добавить его.

...