Я попросил R сохранить JPEG.
Использование в интерактивном режиме через Linux операционную систему и HP CC.
Пт. 17 апреля 14:59:48 2020: вычисление Zscore ...
> jpeg('/scratch/jl5e18/RNA_SEQ/PIDproject/Analysis/normalisedheatmap.jpg')
> plotCountCorHeatmap(ods, colGroups=c("Sex", "Batch", "HDS"),
+ normalize=TRUE)
> dev.off()
null device
1
> make the plot again default size
> options(repr.plot.width=4, repr.plot.height=4)
> jpeg('/scratch/jl5e18/RNA_SEQ/PIDproject/Analysis/abberantsamples.jpg')
> plotAberrantPerSample(ods)
> dev.off()
null device
1
>
> jpeg('/scratch/jl5e18/RNA_SEQ/PIDproject/Analysis/abberantsamplesz2.jpg')
plotAberrantPerSample(ods, padjCutoff=1, zScoreCutoff=2, yadjust=c(1.3,1.4))
dev.off()
^C
)
"
stop
^[^[
^[
^[[A^[[A^[[A^[[A^[[A^[[A^[[A^[[A^[[A^[[A^[[A^[[A^[[A^[[A^[[A^[[A^[[A^[[A^[[A^[[A^[[A
^[^[^[^[^C^C^C
dev.off()
выход, выход, управление q () + C .... ВСЕ ПРОБНО!