Читайте о нормализация , так как обычно для правильно нормализованной базы данных не требуются таблицы с 1024+ столбцами. Если это не поможет, ваш вопрос можно решить, например,
1) подсчитать количество столбцов
SELECT count(*)
FROM information_schema.columns c
JOIN information_schema.tables t ON c.TABLE_NAME = t.TABLE_NAME
AND c.table_schema = t.table_schema
WHERE table_type = 'base table'
and c.table_name ='table_name_here'
2) если больше, чем ожидалось - создайте новую таблицу
CREATE TABLE new_table_name_here
(...)