Различаются ли значения p Stat_compare_means для множественного попарного теста по ggpubr и p-значения pairwise_wilcox.test в R - PullRequest
Новая
       24

Различаются ли значения p Stat_compare_means для множественного попарного теста по ggpubr и p-значения pairwise_wilcox.test в R

0 голосов
/ 17 апреля 2020

Для статистического анализа я хочу показать значения p на ggboxplot для парного сравнения.

Когда я вычислил значения p с помощью: 

stat_compare_means( comparisons = list(c("Normal", "Fazla Kilolu"),
                                     c("Fazla Kilolu", "Klas 1 Obezite"),
                                     c("Klas 1 Obezite", "Klas 2 Obezite")),
                  test = "wilcox.test", size = 2, .adjust.method = "BH")

и 

compare_means(FGF23 ~ BMIL, data = Df_FGF23, ref.group = "Normal", method = "wilcox.test" )

, я получил эти значения p:

enter image description here

Тогда, когда я использовал pairwise.wilcox.test с этим кодом: 

pairwise.wilcox.test(Df_FGF23$FGF23, Df_FGF23$BMIL,p.adjust.method ="BH")

enter image description here

Когда я меняю p .adjust.method = "BH" to p.adjust.method = "None" в pairwise.wilcox.test, тогда я получу первую таблицу. Значения P не изменяются в stat_compare_means с p.adjust.method = "BH".

Почему это происходит? Как я могу решить эти проблемы?

...