Как решить ошибки сходимости с glmer в R? - PullRequest
0 голосов
/ 14 января 2020

Я использую обобщенную линейную смешанную модель, в которой наклон роста дерева является переменной отклика, а поясняющие переменные - график, вид, индекс освещения кроны (масштаб 1-5) и диаметр дерева.

Переменная ответа, хотя и непрерывна, сильно перекошена вправо и содержит много нулей.

Мой код для модели такой:

full.mod1 <- glmer(Slope+0.0001 ~ Plot + 
                 crown_illum_cen + diam_cen + factor(Species) +
          (1|TreeID), family = Gamma (link ="log"), data=data)

Но модель не сходится и выдает это предупреждение:

Предупреждение: In checkConv (attr (opt, "производные"), opt $ par, ctrl = control $ checkConv,: модели не удалось сойтись с max | grad | = 0,13443 (tol = 0,001, компонент 1)

Я пытался:

  • Только проверка гипотез
  • Сокращение объясняющих переменных
  • Центрирование объясняющих переменных

Это привело меня к модели выше, которая все еще не сходится должным образом. я бы go решил это?

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...