Похоже, что dart2 js требует внешнего конструктора фабрики для всех классов, а dartdev c - нет. Например, для первой ошибки, которая возникает сегодня, у вас есть класс, подобный этому:
@JS('Node')
class GoJSNode extends GoJSPart {}
И он должен выглядеть так:
@JS('Node')
class GoJSNode extends GoJSPart {
external factory GoJSNode();
}