Служба AWS Lambda не отслеживает местоположение пакета в S3, поскольку после развертывания версии Lambda сохраняет собственную внутреннюю копию файла JAR и никогда не просматривает S3 снова. Вы можете удалить файл из S3 после развертывания функции, и службе Lambda будет все равно.
Если вы хотите хранить резервные копии на S3, вам нужно управлять этим самостоятельно. Если вы хотите загрузить развернутый в данный момент пакет Lambda, вы можете загрузить zip-файл непосредственно из службы Lambda, ответив на этот вопрос .