Согласно документам Microsoft ссылка , операции CRUD учитываются в пределе API. «Выполнение нескольких» - это, по сути, оболочка, предназначенная для повышения производительности массовых операций. Обратитесь к этой ссылке для получения подробной информации о ExecuteMultiple.
В двух словах, ExecuteMultiple ведет себя так, как будто каждый запрос выполняется отдельно. Таким образом, API limit будет считать все запросы, выполненные ExecuteMultiple, а не один.