При использовании функции модели coxph в r в качестве базовой линии для сравнения всегда принимается коэффициент "Lowest".
Например: набор данных содержит категориальную переменную с 6 различными "этапами"
res.cox <- coxph(
Surv(Follow_Up, Death) ~
as.factor(Patterns)
, data = data)
всегда будет принимать 1-й этап за базовый уровень и сравнивать с ним все остальное
exp(coef) [confint] p
as.factor(stage)2 1.30 [0.23, 7.23] 0.762
as.factor(stage)3 1.60 [0.40, 6.42] 0.508
as.factor(stage)4 3.05 [0.99, 9.40] 0.053
as.factor(stage)5 1.35 [0.36, 5.07] 0.658
Допустим, я хочу, чтобы 5-й этап был моим базовым уровнем. Можно ли это сделать?
Спасибо