Создание набора данных из networkx в pytorch_geometric - PullRequest
0 голосов
/ 06 февраля 2020

Предположим, у меня есть график networkx, и я хочу преобразовать его в набор данных в pytorch_geometri c и использовать его с загрузчиком данных для пакетной обработки. Я попробовал это, но получил некоторую ошибку. Вот код:

import networkx as nx
import torch
import numpy as np
import pandas as pd
from torch_geometric.utils.convert import from_networkx
from torch_geometric.data import DataLoader

from torch_geometric.data import InMemoryDataset


class dataConverterAnjan(InMemoryDataset):
    def __init__(self, root, transform=None, pre_transform=None):
        super(dataConverterAnjan, self).__init__(root, transform, pre_transform)
        self.data, self.slices = torch.load('../a.txt')

    @property
    def raw_file_names(self):
        return []
    @property
    def processed_file_names(self):
        return []

    def download(self):
        pass

    def process(self):
        originalGraph = nx.path_graph(10)
        data = from_networkx(originalGraph)
        data_list = []


        data_list.append(data)

        data, slices = self.collate(data_list)
        torch.save((data, slices), '../a.txt')


dataset = dataConverterAnjan('../')

loader = DataLoader(dataset, batch_size=3, shuffle=True)

Вот ошибка:

Traceback (most recent call last):
  File "pyGeomTest.py", line 36, in <module>
    dataset = dataConverterAnjan('../')
  File "pyGeomTest.py", line 13, in __init__
    self.data, self.slices = torch.load('../a.txt')
  File "/home/anjan/.local/lib/python3.6/site-packages/torch/serialization.py", line 529, in load
    return _legacy_load(opened_file, map_location, pickle_module, **pickle_load_args)
  File "/home/anjan/.local/lib/python3.6/site-packages/torch/serialization.py", line 692, in _legacy_load
    magic_number = pickle_module.load(f, **pickle_load_args)
_pickle.UnpicklingError: unpickling stack underflow

Добро пожаловать на сайт PullRequest, где вы можете задавать вопросы и получать ответы от других членов сообщества.
...