Попробуйте следующее. Замените dbname
именем вашей базы данных и, при необходимости, измените учетные данные и при необходимости измените путь к классу вашей системы:
java -cp $CLASSPATH:/usr/share/java/hsqldbutil.jar:/usr/share/java/hsqldb.jar "org.hsqldb.cmdline.SqlTool" --inlineRc=url=jdbc:hsqldb:hsql://localhost/dbname,user=SA,password= --sql="SHUTDOWN;"
Если ваш дистрибутив поставляется с оболочкой сценария оболочки для SQL Tool, Вы можете сократить это как:
hsqldb-sqltool --inlineRc=url=jdbc:hsqldb:hsql://localhost/dbname,user=SA,password= --sql="SHUTDOWN;"
Вместо использования --inlineRc
вы также можете создать rc-файл с необходимыми параметрами и указать его.