Python в GMS 3.4.x - сбой DM при использовании matplotlib.pyplot: не удалось найти или загрузить плагин платформы Qt для windows

Question

Я не могу заставить matplotlib.pyplot работать под GMS 3.4. Он продолжает сбой DM со следующим сообщением об ошибке

Когда я запускаю этот код (взят из справочного документа DM):

import sys
sys.argv.extend(['-a', ' '])
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt

t = np.arange( 0.0, 3.0, 0.01)
s1 = np.sin(2 * np.pi * t)
plt.plot(t, s1)
plt.show()

Переустановка / восстановление GMS, похоже, не решает проблему. Я довольно новичок в Python, поэтому я мог пропустить что-то очевидное?

Answer 1

Несмотря на то, что исправление, представленное miile7, выполняет свою работу, я хотел бы предложить альтернативное решение:

Как очень хорошо указал miile7, установка глобальной переменной среды может мешать работе другого программного обеспечения и должна быть избегать. Чтобы DM нашел платформу Qt, можно просто

Скопировать папку

ProgramData\Miniconda3\envs\GMS_VENV_PYTHON\Library\plugins\platforms

в

Program Files\Gatan

или, более конкретно, местоположение DigitalMicrograph.exe

Более общую тему, не связанную с GMS, можно найти здесь :

Изменение QT_PLUGIN_PATH в переменных среды приводит к сбою программ

Обновление:

Вероятно, лучше создать соединение, выполнив следующую команду ( с правами администратора):

mklink /J "C:\Program Files\Gatan\platforms" "C:\ProgramData\Miniconda3\envs\GMS_VENV_PYTHON\Library\plugins\platforms"

Проблема по-прежнему решается таким образом, и в случае, если вы обновляете / модифицируете Qt в своей Miniconda, DM все равно должен найти последнюю версию.

Answer 2

Я тоже хотел использовать python в GMS, и у меня возникла та же ошибка. Мне потребовалось несколько часов, чтобы выяснить, почему и как это исправить:

TL; DR

Сохраните следующий код как start-gatan.bat и используйте этот файл start-gatan.bat для запуска GMS. Файл может быть размещен где угодно. Обратите внимание, что окно консоли должно оставаться открытым, пока GMS активен!

@echo off

rem
rem File: start-gatan.bat
rem ---------------------

SET QT_PLUGIN_PATH=%ProgramData%\Miniconda3\envs\GMS_VENV_PYTHON\Library\plugins
SET gms_path=%PROGRAMFILES%\Gatan\DigitalMicrograph.exe

echo Starting GMS
echo Do not close this window!

"%gms_path%"

Важное примечание : чтобы отобразить окно matplotlib, необходимо снять флажок «Выполнить в фоновом потоке» - флажок в нижнем колонтитуле панели кода! Кроме того, выполнение занимает сравнительно много времени.

---

Причина

Это не ошибка GMS и не ошибка python, а ошибка Qt. Для рендеринга windows matplotlib (по умолчанию) используется PyQT, который использует Qt. Ошибка говорит о qwindows.dll и о том, что он не может быть найден (явно?).

Примечание: : Средство визуализации можно изменить , добавив, например, matplotlib.use('GTK3Agg'). Это больше не показывает Qt -Error, но показывает другую ошибку, поэтому я не следовал этой идее.

Решение

qwindows.dll находится в %ProgramData%/Miniconda3/envs/GMS_VENV_PYTHON/Library/plugins/platforms. Путь для плагинов платформы может быть установлен в qt.conf (но это не исправило меня, который, в этой теме упоминают, что могут быть различия ) или в переменной среды %QT_PLUGIN_PATH% как я нашел здесь .

Поэтому добавьте (создайте) системную переменную %QT_PLUGIN_PATH% со значением %ProgramData%\Miniconda3\envs\GMS_VENV_PYTHON\Library\plugins. Системная переменная в Windows может быть добавлена ​​в Панель управления > Система > Расширенные настройки системы > Переменные среды . ¹

Обратите внимание, что эта переменная среды должна присутствовать только для GMS, а не для всех других программ QT. Поэтому создайте start-gatan.bat и скопируйте код в верхней части раздела TL; DR. Теперь запустите GMS, дважды щелкнув по start-gatan.bat, и ваш пример кода будет работать.

Важное примечание : чтобы показать окно matplotlib, вы должны снять галочку с «Выполнить в фоновом потоке» - флажок в нижнем колонтитуле панели кода, иначе окно графика не будет видно.

¹ Добавление новой переменной среды работает, но если у вас есть еще одна программа, использующая QT (которая очень скорее всего, причина) вы столкнетесь с (почти) тем же сообщением об ошибке, но в другой программе. Если у вас есть только GMS pyqt, использующая QT, это может быть вашим решением.

Дополнительные примечания

Несколько тем форума , включая форум QT , рассказывают о дублирующих путях для этого qwindows.dll. Если мой ответ не помог вам, вы можете посмотреть на это. Обратите внимание, что проверка переменных среды должна выполняться в среде Miniconda. Поэтому обязательно запустите

activate GMS_VENV_PYTHON

перед выводом переменных. Также вы можете захотеть взглянуть на конфигурацию qt, которую можно найти по %PROGRAMDATA%/Miniconda3/envs/GMS_VENV_PYTHON/bin. Обратите внимание, что всегда есть файл в обычной директории Miniconda (%PROGRAMDATA%/Miniconda3/bin) и файл в envs.

Answer 3

Проверенный метод для запуска MatplotLib в GMS
_{(протестирован с GMS 3.4.1.2938 бета)}

• Запуск с чистой системы ( GMS не установлена, Python -for-GMS Miniconda не установлена)
• Установить GMS с установщиком и включенной опцией Python.
• Запустить приглашение Anaconda с правами администратора (справа) щелкните элемент в меню «Пуск»)
  
• Чтобы активировать среду GMS_VENV_ PYTHON, введите activate GMS_VENV_PYTHON
• Установите Matplotlib с помощью программы установки pip, набрав pip install Matplotlib (требуется соединение inte rnet)
• Запустите DigitalMicrograph и запустите следующий тест-скрипт:

# This is a PYTHON script to be run in DigitalMicrograph
if ( False == DM.IsScriptOnMainThread() ):
    print( ' MatplotLib scripts require to be run on the main thread.' )
    exit()

import sys
sys.argv.extend(['-a', ' '])
import matplotlib.pyplot as plt
import numpy as np
a = np.linspace(0, 10, 100)
b = np.exp(-a)
plt.plot(a, b)

DM.ClearResults()
print('Start plotting. Script continues when figure is closed')
plt.show()
print('Done plotting.')

И в качестве бонуса, поскольку речь идет о сценариях DM: используя возможность гибридного сценария, можно заключить вызов Python в строку и выполнить его непосредственно изнутри DM-скрипт:

// This is a DM-script
string pyScript
pyScript += "import sys" + "\n"
pyScript += "sys.argv.extend(['-a', ' '])" + "\n"
pyScript += "import matplotlib.pyplot as plt" + "\n"
pyScript += "import numpy as np" + "\n"
pyScript += "a = np.linspace(0, 10, 100)" + "\n"
pyScript += "b = np.exp(-a)" + "\n"
pyScript += "plt.plot(a, b)" + "\n"
pyScript += "plt.show()" + "\n"

ClearResults()
Result( "Script continues when figure is closed\n" )
ExecutePythonScriptString( pyScript, 1 ) // On Main-thread
Result( "Done plotting.\n" )