У меня Vagrant VM, использующая Virtualbox.
В моей папке root много файлов, которые появляются в папке /vagrant внутри виртуальной машины.
/vagrant
Когда я выключаю и перезапустите его, папка /vagrant пуста.
Почему?
Как вы выключаете и перезагружаете виртуальный компьютер?
Бродит, кто монтирует этот каталог.
Если вы выполняете эти операции непосредственно из VirtualBox, он не будет монтироваться.