Один экземпляр означает, что только один из этих точных экземпляров существует во всем приложении. У элемента управления может быть только один владелец, но не несколько.
Таким образом, один экземпляр не может существовать с несколькими владельцами, поэтому это невозможно сделать.
Однако на основе на то, что вы описываете, то в этом тоже нет необходимости. Вы не хотите, чтобы один экземпляр требовал, чтобы несколько элементов управления работали одинаково в одно и то же время. Поэтому сохраните все панели в списке или массиве, а затем переберите их и примените новый цвет фона, когда это необходимо. Вот так.
//Create a list on your form level.
private List<Panel> PanelList { get; set; }
//Store a list of Panels. You can also add them manually.
//Do this after initialisation of your form and all controls are added.
this.PanelList = this.Controls.OfType<Panel>().ToList();
//When required, call this method
private void UpdatePanelBackgroundColor(Color backColor)
{
foreach (var panel in this.PanelList)
panel.BackColor = backColor;
}