Обычно программы Graphviz стараются избегать размещения узлов поверх других узлов. Но вы можете размещать узлы где угодно, если вы явно предоставляете атрибут pos для каждого узла (см. https://graphviz.org/faq/#FaqDotWithNodeCoords).
Программа, которая создает ваши входные файлы, должна вычислить pos атрибут для каждого узла. (Помните, что pos координаты находятся в точках , а размеры узлов в дюймах !). Возможно, вы можете пропустить вычисление сплайнов для ребер и просто позвольте neato сделать это.
Эта программа:
digraph {
graph [bb="0,0,482.8,337"];
node [label="\N"];
State1 [height=4.0139,
label="{State 1|\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n\n}",
pos="162,144.5",
shape=Mrecord,
width=4.5];
State2 [height=1.3333,
label="{State 2|\n\n\n\n}",
// pos="403,144.5",
pos="220,88",
shape=Mrecord,
width=1.6944];
xp3 [height=0.05,
label="",
// pos="429,331",
pos="0,194",
shape=point,
// style=dotted,
style=invis,
width=0.05];
r1 [height=0.16667,
label="",
// pos="455,331",
pos="154,194",
shape=square,
width=0.16667];
xp4 [height=0.05,
label="",
// pos="481,331",
pos="0,88",
shape=point,
// style=dotted,
style=invis,
width=0.05];
xp1 [height=0.16,
label="",
pos="162,331",
shape=point,
width=0.16];
xp1 -> State1:n [pos="e,162,288.5 162,325.23 162,319.09 162,308.89 162,298.63",
style=dashed];
xp2 [height=0.16,
label="",
// pos="403,331",
pos="220,194",
shape=point,
width=0.16];
xp2 -> State2:n [pos="e,403,192.5 403,325.19 403,307.39 403,251.8 403,202.57"];
// manually added:
xp3 -> r1 [label="Trigger 1" dir=none ]
xp4 -> State2 [label="Trigger 2" ]
}
Запустить с этой командной строкой:
neato -n -Tpng stateDiagram.dot> stateDiagram.png
Создает этот график: