Проверьте версию Python IDE, затем выполните это в командной строке:
py -{yourVersion} -m pip install pynput
note: {yourVersion} - это только основная и дополнительная версии. Например, если вы используете 3.7.3, введите py -3.7 -m pip install pynput
вместо py -3.7.3 -m pip install pynput
close, а затем повторно запустите ту же версию IDE, которую вы запускали ранее.
import pynput
это должно решить вашу проблему.