Использовать синтаксис from packagename import namespace
Пример:
from ij import IJ, ImagePlus
from ij.plugin.filter import RankFilters
imp = IJ.getImage()
ip = imp.getProcessor().convertToFloat()
radius = 2
RankFilters().rank(ip, radius, RankFilters.MEDIAN)
imp2 = ImagePlus(imp.title + " median filtered", ip)
imp2.show()
Вы можете найти имя определенных c плагинов, выполнив поиск в поиске команд.