Обычно это связано с проблемой прокси.
Двойная проверка:
env|grep -i proxy
git config -l | grep -i proxy
Но это не объясняет, почему pu sh работает, а клон - нет.
Если это так, отметьте в этом случае и убедитесь, что у вас нет других программ / IDE, выполняющих pu sh, в то время как вы пытаетесь создать / клонировать.