python glob.glob больше не работает, верните пустой список

Question

Я бегу в очень странном случае ... Вчера я написал небольшой сценарий. Его цель - проверить одно условие в файле на основе другого файла. Это сработало как задумано. Но с этого утра это не так. Я ничего не изменил, насколько мне известно. код не выдает никакой ошибки. Я думаю, что виновником является glob.glob

for file in glob.glob('*private.vcf.gz'):
    seen = False
    vcf = VCF(file)
    print("test")
    if not (file == "controlH.g.vcf.gz" or file == "output.g.vcf.gz"):
        sample_name = file.split('.')[0]
        out = "{}.FalsePositiveRefCallPurged.vcf".format(sample_name)
        w = Writer(out, vcf)
        for v in vcf:
            seen = False
            ref = VCF('output.g.vcf.gz')
            for r in ref:
                if seen :
                    break
                if not seen:
                    if v.CHROM == r.CHROM:
                        if v.start == r.start or v.start > r.start and v.start < r.end:
                            if r.FILTER == "RefCall":
                                continue#print(str(v))
                            else:
                                w.write_record(v)
                            seen = True
        w.close()

Действительно, при простом запуске

glob.glob('.*private.vcf.gz')

я получаю пустой список. Вот вывод bash

ls *.private.vcf.gz
D2A1.private.vcf.gz  D3A1.private.vcf.gz  D5B3.private.vcf.gz  H2C3.private.vcf.gz  H4C2.private.vcf.gz
D2B3.private.vcf.gz  D4A3.private.vcf.gz  H2A3.private.vcf.gz  H4A4.private.vcf.gz  H5A3.private.vcf.gz

Так что я уверен, что файлы есть ... Я действительно не понимаю, почему вдруг glob.glob не может найти их.

Любая помощь будет принята с благодарностью, спасибо

Answer 1

Хорошо, похоже, что директория

/.ipynb_checkpoints

создана, и моя тетрадь использует ее как каталог по умолчанию ...