Вам необходимо получить сертификат для подписи кода (который отличается от сертификата сервера SSL) в центре сертификации и подписать свои программы с ним. Существуют определенные требования для получения такого сертификата; например, некоторые центры сертификации потребуют документацию вашей компании и т. д.