Насколько я могу судить, есть два способа сделать то, что вы хотите. Оба они требуют значительных дополнительных накладных расходов. Оба также, вероятно, потребуют, чтобы example.domain.com лгал о том, кто это.
Я бы не советовал, если вы можете избежать этого, но.
Метод № 1
Настройте прозрачный прокси на www.domain.com/folder для отображения содержимого из example.domain.com. Если я правильно помню, это можно сделать с помощью mod_proxy, но я не помню, как именно.
Метод № 2
Настройте правило перезаписи на www.domain.com/folder для перенаправления на example.domain.com. Затем настройте example.domain.com, чтобы либо лгать о том, кто и где он находится, либо исправить все ссылки на страницах на example.domain.com, чтобы явно перейти на http://www.domain.com/folder.
В корневом .htaccess файле на www.domain.com: (для перенаправления на поддомен)
RewriteRule ^folder/(.*) http://example.domain.com/$1 [R, L]