Из того, что я могу сказать, вы просто хотите сохранить весь код внутри функции, чтобы ваша переменная выбора была локально ограничена этой функцией.
Решение
Другими словами, измените ваш Javascript к следующему:
function clickme() {
let choice = confirm('do you accept Jesus');
if (choice) {
alert("you pressed ok");
}
else {
alert("are you sure you want to cancel");
}
}
Если это не то поведение, которое вы ищете, пожалуйста, обновите ваш вопрос тем, что вы хотите, чтобы произошло.