Хорошо, я решил это, выполнив это так
ManagedMobileLobAppRequestBuilder builder = new ManagedMobileLobAppRequestBuilder($"{client.BaseUrl}/deviceAppManagement/mobileApps/{newItem.Id}/{newItem.ODataType.Substring(1)}", client);
var result = await builder.ContentVersions.Request().AddAsync(new MobileAppContent());
Не уверен, что это правильный способ, но он работает!