Ядро продолжает умирать и перезапускаться при запуске некоторых строк в python Notebook - PullRequest
Новая
       8

Ядро продолжает умирать и перезапускаться при запуске некоторых строк в python Notebook

0 голосов
/ 16 января 2020

Я получаю сообщение об ошибке -> 

/apps/anaconda3/bin/python: symbol lookup error: /apps/anaconda3/lib/python3.6/site-packages/mkl/../../../libmkl_intel_thread.so: undefined symbol: omp_get_num_procs

Чтобы исправить это, я попытался обновить пакет mkl, выполнив «conda update mkl», а затем перезапустив службу jupyterhub. Но, тем не менее, проблема сохраняется.

файл libmkl_intel_thread.so находится по нижеуказанным путям - 

/apps/anaconda3/envs/myEnv/lib/libmkl_intel_thread.so
/apps/anaconda3/lib/libmkl_intel_thread.so
/apps/anaconda3/pkgs/mkl-2017.0.1-0/lib/libmkl_intel_thread.so
/apps/anaconda3/pkgs/mkl-2019.4-243/lib/libmkl_intel_thread.so

my $ PATH is -> 

/apps/anaconda3/envs/myEnv/bin:/apps/anaconda3/condabin:/apps/anaconda3/bin:/opt/mssql-tools/bin:/apps/anaconda3/lib/python3.6/site-packages:/apps/anaconda3/envs/myEnv:/apps/anaconda3/envs/myEnv/bin:/apps/anaconda3/bin:/usr/local/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin

Что может быть не так?

1 Ответ

1 голос
/ 20 января 2020

Похоже, вам не хватает libiomp5.so. Вместо обновления можно запустить conda update intel-openmp? Также убедитесь, что файл находится в вашем LD_LIBRARY_PATH. Взгляните на этот отчет об ошибке: github.com / ContinuumIO / проблемы с анакондой / проблемы / 10195

...