Как мне связать файл Rmarkdown в файл html, который встраивает графики? - PullRequest
0 голосов
/ 20 апреля 2020

В файле Rmd есть несколько мест, где создаются графики, например,

```{r outliers}
influencePlot (model1)
```

Я связываю файл в файл html и несколько файлов изображений в каталоге ./figure/, запустив в сеанс R

> library(knitr)
> knit("my.Rmd")

, который затем выполняется в сеансе bash

$ pandoc my.md -f markdown -t html -s -o my.html

, но файл html не встраивает графики из файлов изображений, например:

<img src="figure/outliers-1.png" alt="plot of chunk outliers" />

Мне было интересно, как я могу сделать так, чтобы файл html вставлял графики из файлов изображений и становился автономным?

В RStudio, когда я нажимаю "вязать" * 1026 Кнопка * ", она встраивает изображения графика в файл html, например

<p><img src="data:image/png;base64,iVBORw0KGgoAAAANSUhE...

Какие команды эквивалентны кнопке RStudio" knit to html "?

Спасибо.

1 Ответ

2 голосов
/ 20 апреля 2020

Какие команды эквивалентны кнопке RStudio "knit to html"?

Отправьте свои выходные данные в заголовок YAML и затем используйте

rmarkdown::render("Your-RMD-file.Rmd")

Или посмотрите документацию для функции рендеринга и их аргументы.

...