Вы можете создать файл запуска (ярлык). Вам нужно создать файл с текстом:
#!/bin/sh
java -jar myProject.jar
и сделать его исполняемым:
chmod + x ./shortcutfile
ИЛИ
Щелкните правой кнопкой мыши на jar-файле. Выберите «Открыть с помощью другого приложения» и выберите «Среда выполнения».