Прежде всего, я хотел бы повторить мнение других ответов, так как проверка скомпилированных исходных файлов в системе контроля версий - очень плохая идея, так как каждый раз, когда кто-то вносит изменения в источник, они ' Вам придется помнить, чтобы проверить соответствующий файл класса.
Что касается вашего конкретного вопроса, на этой странице говорится, что все сгенерированные файлы .class автоматически помечаются как производные, то есть они не будут автоматически проверяться:
Любой ресурс, помеченный как производный, будет автоматически игнорироваться командой CVS для управления версиями. Некоторые компоновщики, такие как компоновщик Java, отмечают все свои выходные данные сборки (например, файлы классов) как производные.
Насколько мне известно, нет способа изменить это, что должно подчеркнуть, что это плохая идея.