Одна идея - создать группы по каждому 1
начальному значению и агрегировать пользовательскую лямбда-функцию для кортежей:
df['new'] = (df['ID'] == 1).cumsum()
print (df)
ID x y new
0 1 x1 y1 1
1 0 x2 y2 1
2 0 x3 y3 1
3 2 x4 y4 1
4 1 x5 y5 2
5 2 x6 y6 2
df1 = (df.groupby('new')['x','y']
.apply(lambda x: list(map(tuple, x.values.tolist())))
.reset_index(name='coordinates'))
print (df1)
new coordinates
0 1 [(x1, y1), (x2, y2), (x3, y3), (x4, y4)]
1 2 [(x5, y5), (x6, y6)]
Аналогичное решение без нового столбца:
df1 = (df.groupby((df['ID'].rename('new') == 1).cumsum())['x','y']
.apply(lambda x: list(map(tuple, x.values.tolist())))
.reset_index(name='coordinates'))
print (df1)
new coordinates
0 1 [(x1, y1), (x2, y2), (x3, y3), (x4, y4)]
1 2 [(x5, y5), (x6, y6)]
РЕДАКТИРОВАТЬ:
print (df)
ID x y
0 1 x1 y1
1 0 x2 y2
2 0 x3 y3
3 2 x4 y4
4 0 x7 y7
4 0 x8 y8
4 1 x5 y5
5 2 x6 y6
g = df['ID'].eq(1).cumsum()
s = df['ID'].shift().eq(2).cumsum()
df = df[s.groupby(g).transform('min').eq(s)]
print (df)
ID x y
0 1 x1 y1
1 0 x2 y2
2 0 x3 y3
3 2 x4 y4
4 1 x5 y5
5 2 x6 y6
df1 = (df.groupby((df['ID'].rename('new') == 1).cumsum())['x','y']
.apply(lambda x: list(map(tuple, x.values.tolist())))
.reset_index(name='coordinates'))
print (df1)
new coordinates
0 1 [(x1, y1), (x2, y2), (x3, y3), (x4, y4)]
1 2 [(x5, y5), (x6, y6)]