Экстракция круговых ROI с использованием tifffastcrop - PullRequest
0 голосов
/ 30 марта 2020

Я использую библиотеку LargeTIFFTools при работе над решением для извлечения небольших изображений .tiff из больших изображений .tiff иммуногистохимии.

Модуль tifffastcrop в этой библиотеке в основном работает используя команду

tifffastcrop [options] -E x,y,w,l input.tif [output]

, где x, y, w и l соответствуют декартовым координатам, ширине и длине выбранной области интереса. Это предполагает, что ROI является прямоугольным angular.

Некоторые из ROI, которые мне нужно извлечь, являются круглыми, и мне интересно, возможно ли использовать / изменить эту команду.

Если необходимо изменить код в указанных исходных файлах, может кто-нибудь указать мне правильное направление?

Спасибо!

...