Меня просят построить графики концентрации E, S, ES и P относительно подходящего времени (я выбрал одну минуту с интервалами в одну секунду?), Учитывая следующее:
E + S <- > ES
ES -> E + P
, где скорости реакции для первой реакции составляют 1,06 * 10 ^ 7 М ^ -1 с ^ -1 и 1,49 * 10 ^ 1 М ^ -1 с ^ -1. Для второй реакции скорость реакции составляет 1,6 * 10 ^ 3 М ^ -1 с ^ -1.
Начальные концентрации фермента и субстрата составляют 5 * 10 ^ -10 и 5 * 10 ^ -2 соответственно. Обратите внимание, следует использовать ode23.
Я попытался решить проблему с помощью следующего кода:
endconc=[];
for i=1:4
E=5e-10;
S=5e-2;
ES=0; P=0;
k1=1.06e7;
k2=1.49e1;
k3=1.6e3;
% E= u(1)
% S= u(2)
% ES=u(3)
% P= u(4)
%system of ODE
uprim = @(t,u) [-k1*u(1)*u(2)+k2*u(3)-k3*u(3);
-k1*u(1)*u(2)+k2*u(3)-k3*u(3);
k1*u(1)*u(2)-k3*u(1)*u(4);
k3*u(3);];
E0=E; S0=S; ES0=ES; P0=P;
u0=[E0; S0; ES0; P0;];
ops = odeset('AbsTol',1e-9,'RelTol',1e-9);
end
[t,U] = ode23s(uprim,0:60,u0,ops);
plot(t,U)
Однако график выглядит не совсем правильно. Я сделал ошибку в системе ODE или я неправильно понял использование данных концентраций?
Вся помощь очень ценится!