Простой ответ: вы не можете. Если IIS обнаруживает изменение в одном из двоичных файлов, он должен перезагрузиться, чтобы убедиться, что он использует правильные двоичные файлы.
Реальные вопросы:
a) Действительно ли IIS обнаруживает изменение, или это происходит из-за "колебаний", заставляющих ОС думать, что файлы не были моментально?
б) Если «колебания» являются корнем проблемы, то что их вызывает? Как это можно решить?