Это будет хорошо:
mysqldump --single-transaction --user=user_name --password=your_password redmine_database > backup.sql
Будет выгружено все содержимое базы данных redmine_database в файл backup.sql.
Обновление:
Что касается резервного копирования "apache", как я отмечаю в своем комментарии ниже - вам не нужно или не нужно создавать резервную копию вашей установки apache. Если вам когда-нибудь понадобится восстановить вашу систему, apache нужно будет переустановить, как и в любом другом приложении. Если вы ссылаетесь на фактические файлы и каталоги в вашей установке redmine, их также не нужно резервировать за исключением для каталога files /, который содержит загруженные пользователем файлы для redmine. Вы можете сделать резервную копию всей установки redmine (для безопасности) с помощью следующей команды:
tar czvf redmine_backup.tar.gz /path/too/redmine/installation