Невозможно скомпилировать развернутую QR-декомпозицию с помощью Eigen (через RcppEigen) - PullRequest
Новая
       13

Невозможно скомпилировать развернутую QR-декомпозицию с помощью Eigen (через RcppEigen)

0 голосов
/ 21 апреля 2020

Как опытный пользователь R, не имеющий знаний в C ++ и OOP в целом, я хотел бы УЗНАТЬ QR-разложение с библиотекой алгебры матриц Eigen (через R-пакет RccpEigen) из-за его ожидаемой высокой производительности. Когда я запускаю следующий фрагмент кода (первый пример из здесь - я добавил первые 2 строки, которые, однако, не влияют на выходные данные) через 'source Cpp': 

sourceCpp(code='
// [[Rcpp::depends(RcppEigen)]]
#include <RcppEigen.h>
#include <iostream>
#include <Eigen/Dense>

using namespace std;
using namespace Eigen;

int main()
{
   Matrix3f A;
   Vector3f b;
   A << 1,2,3,  4,5,6,  7,8,10;
   b << 3, 3, 4;
   cout << "Here is the matrix A:\n" << A << endl;
   cout << "Here is the vector b:\n" << b << endl;
   Vector3f x = A.colPivHouseholderQr().solve(b);
   cout << "The solution is:\n" << x << endl;
}
')

Я получаю следующее (длинное, извините) сообщение: 

C:/Rtools/mingw_64/bin/g++ -std=gnu++11  -I"C:/PROGRA~1/R/R-36~1.3/include" - 
DNDEBUG   -I"C:/Users/W10PRO~1/DOCUME~1/R/WIN-LI~1/3.6/Rcpp/include" - 
I"C:/Users/W10PRO~1/DOCUME~1/R/WIN-LI~1/3.6/RCPPEI~1/include" - 
I"C:/Users/W10PRO~1/AppData/Local/Temp/RTMPO2~1/SOURCE~1.3"        -O2 -Wall  
-mtune=core2 -c file2b0301f29d8.cpp -o file2b0301f29d8.o
file2b0301f29d8.cpp:16:11: warning: missing terminating " character
cout << "Here is the matrix A:

file2b0301f29d8.cpp:16:3: error: missing terminating " character
cout << "Here is the matrix A:

file2b0301f29d8.cpp:17:1: warning: missing terminating " character
 " << A << endl;
file2b0301f29d8.cpp:17:1: error: missing terminating " character
file2b0301f29d8.cpp:18:11: warning: missing terminating " character
cout << "Here is the vector b:
       ^
file2b0301f29d8.cpp:18:3: error: missing terminating " character
cout << "Here is the vector b:

file2b0301f29d8.cpp:19:1: warning: missing terminating " character
 " << b << endl;

file2b0301f29d8.cpp:19:1: error: missing terminating " character
file2b0301f29d8.cpp:21:11: warning: missing terminating " character
cout << "The solution is:

file2b0301f29d8.cpp:21:3: error: missing terminating " character
cout << "The solution is:

file2b0301f29d8.cpp:22:1: warning: missing terminating " character
 " << x << endl;

file2b0301f29d8.cpp:22:1: error: missing terminating " character
file2b0301f29d8.cpp: In function 'int main()':
file2b0301f29d8.cpp:20:12: error: expected primary-expression before 'x'
Vector3f x = A.colPivHouseholderQr().solve(b);
        ^
file2b0301f29d8.cpp:23:1: error: expected primary-expression before '}' token
}

make: *** [C:/PROGRA~1/R/R-36~1.3/etc/x64/Makeconf:215: file2b0301f29d8.o] 
Error 1
Error in sourceCpp(code = "\n// [[Rcpp::depends(RcppEigen)]]\n#include 
<RcppEigen.h>\n#include <iostream>\n#include <Eigen/Dense>\nusing namespace 
std;\nusing namespace Eigen;\n\n// [[Rcpp::export]]\nint main()\n{\n  
Matrix3f A;\n  Vector3f b;\n  A << 1,2,3,  4,5,6,  7,8,10;\n  b << 3, 3, 4;\n  
cout << \"Here is the matrix A:\n\" << A << endl;\n  cout << \"Here is the 
vector b:\n\" << b << endl;\n  Vector3f x = 
A.colPivHouseholderQr().solve(b);\n  cout << \"The solution is:\n\" << x << 
endl;\n}\n") : 
Error 1 occurred building shared library.

Это моя конфигурация R / C ++ (без компилятора g cc?): 

library(Rcpp)            # 1.0.3
library(RcppEigen)       # v. 0.3.3.7.0
RcppEigen:::eigen_version(FALSE) 
3     3     7 
find_rtools()
[1] TRUE
evalCpp("2+2")
[1] 4
has_compiler()
[1] TRUE
check_compiler()
[1] TRUE
check_build_tools()
>Your system is ready to build packages!
Sys.which("make")
"C:\\Rtools\\bin\\make.exe" 
Sys.getenv('PATH')
[1] "C:\\Program Files\\R\\R- 3.6.3\\bin\\x64;C:\\Rtools\\bin; etc
system('gcc -v')
127

sessionInfo()
> R version 3.6.3 (2020-02-29)
> Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)
> Running under: Windows >= 8 x64 (build 9200)
> attached base packages:
[1] stats     graphics  grDevices utils     datasets  methods   base     

other attached packages:
[1] pkgbuild_1.0.6      devtools_2.3.0      usethis_1.6.0       inline_0.3.15       
RcppEigen_0.3.3.7.0
[6] Rcpp_1.0.3         

loaded via a namespace (and not attached):
....

Любая помощь, пожалуйста? [Почему «система ('g cc -v')» дает 127?]

...