Если clock_in && clock_out являются форматом даты и времени, вы должны преобразовать их в следующий формат:
$getClock = DB::table('clocks')>where('user_id', Auth::id())
->orderBy('created_at')->first();
$clockIn = date('Y-m-d H:i:s',strtotime($request->clock_in));
$getClock->update(['clock_out' => $clockIn]);