У меня та же проблема, хотя я использовал дерево CSG для запуска логического объединения, но я предполагаю, что он выполняет ту же логическую операцию.
В моем случае я делаю логическое значение для двух STL-файлы, одна из которых - странная модель размером 20 МБ (в основном это человек с волосами и волосами без объема, это просто множество треугольников, составляющих 2D линии), и я подозреваю, что pyme sh сходит с ума, когда сталкивается с этим файлом (хотя я не могу сказать наверняка). Docker останавливается с кодом выхода 137
(который может произойти из-за docker, убивающего процесс, потому что он использует слишком много памяти).
Есть ли в вашем файле что-то необычное? Какое docker изображение вы используете?
Возможно, стоит открыть вопрос о pyme sh github repo.
Я использую изображение pymesh/pymesh:py3.7
docker на хост-компьютер Debian с 2 ГБ ОЗУ