Операции - это атомы c для одной операции в одном контейнере. Если вы используете хранимую процедуру, вы можете выполнить несколько операций atomi c в одном разделе внутри одного контейнера.
Вы не можете выполнять любые операции atomi c в нескольких контейнерах или в нескольких перегородки одного контейнера. Это не имеет никакого отношения к используемой языковой среде (например, NET, как вы упомянули). Так работает служба Cosmos DB.