Python cra sh при импорте boost / c ++ при использовании anaconda - PullRequest
1 голос
/ 21 апреля 2020

Я пытаюсь построить интерфейсы движка c ++ для python, используя boost / python. Импорт python завершается неудачно в среде анаконды. Я сократил c ++ до следующего (простой python. cpp), который все еще не работает:

#include <boost/python/module.hpp>
#include <boost/python/class.hpp>

namespace R3 {
  class Coordinate {
  public:
    Coordinate() : x(0), y(0), z(0) {}
    Coordinate(int _x, int _y, int _z) : x(_x), y(_y), z(_z) {}
    double getX() const { return x;}
    double getY() const { return y;}
    double getZ() const { return z;}
  private:
    double x, y, z;
  };
}

BOOST_PYTHON_MODULE(simplepython) {
  // An established convention for using boost.python.
  using namespace boost::python;
  Py_Initialize();

  class_<R3::Coordinate>("R3Coordinate", init<>())
    .def(init<int, int, int>())
    .def("getX", &R3::Coordinate::getX)
    .def("getY", &R3::Coordinate::getY)
    .def("getZ", &R3::Coordinate::getZ)
  ;
}

, пробуя это:

$> python - c 'import sys; печать (sys.executable); импорт простой python

... SystemError: инициализация _heapq не вернула модуль расширения

Sys / build details:

Ma c ОС Mojave, 10.14.6 Python версия 3.7.4, Conda 4.8.3 C ++ и др.: Apple clang версия 11.0.0 (clang-1100.0.33.17)

установка conda была: установка conda - c Anaconda Boost

Буст-версия: boost-1.67.0

Сборка :

g ++ -I / opt / anaconda3 / include / python3 .7m -I / opt / anaconda3 / include / python3 .7m -I / opt / anaconda3 / include -O2 -fPI C -std = c ++ 11 -Включить - c -o objs / simple python .o src / simple python. cpp

g ++ -Wl, -rpath, / opt / anaconda3 / lib -shared -o lib / simple python .so objs / simple python .o -L / opt / anaconda3 / lib -Llib -l python3 .7m -ldl -framework CoreFoundation -lboost_python37 -lboost_numpy37

Полные результаты:

/opt/anaconda3/bin/python
Error processing line 1 of /opt/anaconda3/lib/python3.7/site-packages/matplotlib-3.1.1-py3.7-nspkg.pth:

Fatal Python error: initsite: Failed to import the site module
Traceback (most recent call last):
  File "/opt/anaconda3/lib/python3.7/site.py", line 168, in addpackage
    exec(line)
  File "<string>", line 1, in <module>
  File "/opt/anaconda3/lib/python3.7/importlib/util.py", line 14, in <module>
    from contextlib import contextmanager
  File "/opt/anaconda3/lib/python3.7/contextlib.py", line 5, in <module>
    from collections import deque
  File "/opt/anaconda3/lib/python3.7/collections/__init__.py", line 24, in <module>
    import heapq as _heapq
  File "/opt/anaconda3/lib/python3.7/heapq.py", line 587, in <module>
    from _heapq import *
SystemError: initialization of _heapq did not return an extension module

During handling of the above exception, another exception occurred:

Traceback (most recent call last):
  File "/opt/anaconda3/lib/python3.7/site.py", line 579, in <module>
    main()
  File "/opt/anaconda3/lib/python3.7/site.py", line 566, in main
    known_paths = addsitepackages(known_paths)
  File "/opt/anaconda3/lib/python3.7/site.py", line 349, in addsitepackages
    addsitedir(sitedir, known_paths)
  File "/opt/anaconda3/lib/python3.7/site.py", line 207, in addsitedir
    addpackage(sitedir, name, known_paths)
  File "/opt/anaconda3/lib/python3.7/site.py", line 178, in addpackage
    import traceback
  File "/opt/anaconda3/lib/python3.7/traceback.py", line 3, in <module>
    import collections
  File "/opt/anaconda3/lib/python3.7/collections/__init__.py", line 24, in <module>
    import heapq as _heapq
  File "/opt/anaconda3/lib/python3.7/heapq.py", line 587, in <module>
    from _heapq import *
SystemError: initialization of _heapq did not return an extension module

Спасибо за любую помощь!

1 Ответ

1 голос
/ 06 мая 2020

Оказывается, ошибка связана не только с Py_Initialize(), но с символической связью c между программой и python средой выполнения. Следующее решение полностью решило:

В строке ссылки замените -lpython<version>m на -undefined dynamic_lookup.

Кредиты : Nehal J Wani первоначально сообщил об этом решении, см. Его ответ на этот вопрос .

ПРИМЕЧАНИЕ : я использовал $(shell python3-config --libs) для получения этих путей -l, которые, к сожалению, включают -l python <<em> версия > м; а с версии 3.8 на нее не будет. Из-за этого несоответствия я просто пока использую свои собственные расширенные данные.

Благодарность и благодарность : Nehal J Wani

...