AFAIK, вам нужно выложить в SQL, чтобы иметь возможность сделать это в SubSonic. Каждая СУБД имеет свой синтаксис для изменения начального числа, но если вы знаете, какую СУБД вы используете, вводить немного SQL не сложно. Например, для SQL Server из C # код будет выглядеть примерно так:
new InlineQuery("DBCC CHECKIDENT (\"MyTable.ColumnName\",RESEED,300)").Execute();