Извлечь числа между строкой и второй пустой строкой: BASH и python

Question

Вопрос похож на многие предыдущие вопросы по SO. Но кажется достаточно отчетливым.

У меня есть файл данных, который имеет следующий вывод. Числа должны быть извлечены. Количество элементов в числовом блоке является случайным, и над и под числовым блоком есть одна пустая строка. Цель состоит в том, чтобы извлечь числа и, возможно, присвоить их массиву python numpy.

string 1 

234034 6361234 45096 12342134 2878814 456456
125294 7341234 17234 23135   768234  54134123
213203 6.25 2.36 1.0 0.0021 

string 2 

298034 20481234 45096 12502134 2870814 456456
19875294 441284 98234 27897135 251021524  768234  54134123
2.3261

string 3 

744034 6644034 75096 5302134 298978814 456456
6767294 70441234 330234 200135   867234  54004123
204203 22015 120158 125 21  625 11 5 2.021

---

Ожидаемый результат: Числа из всех блоков расположены в виде bash массивов или numpy (python) массивов. Числовые значения c, показанные ниже, являются только репрезентативными.

• Bash массив: '744034', '6644034', '75096', .. .. '21', '625', ' 11 ',' 5 ',' 2.021 '

или

• Numpy массив: [744034,6644034,75 ...., 625, 11,5,2.021]

  Мой вариант использования предпочитает массив numpy.

---

Принимая реплику из предыдущего вопроса , пробовал это sed -n '/^symmetry 1$/,/^symmetry 2$/p' file, но вывод равен нулю, возможно, из-за пробела в начальных и конечных поисковых терминах.

---

Попытка python, поскольку в конечном итоге мне нужны числа в виде массива np. Из вопроса и справки в комментариях я получаю один блок, используя следующий код

import sys
import re
F=open(sys.argv[1])
text=F.read()
reg=re.compile(r'string 1(.*?)string 2',re.DOTALL)
for match in reg.finditer(text):
    print (match.groups())

,

string 1 

744034 6644034 75096 5302134 298978814 456456
6767294 70441234 330234 200135   867234  54004123
204203 22015 120158 125 21  625 11 5 2.021

 string 2

Нужны предложения.

Answer 1

Вы не показываете ожидаемый результат, но это то, что вы пытаетесь сделать?

$ awk -v RS= '!(NR%2)' file
234034 6361234 45096 12342134 2878814 456456
125294 7341234 17234 23135   768234  54134123
213203 6.25 2.36 1.0 0.0021
298034 20481234 45096 12502134 2870814 456456
19875294 441284 98234 27897135 251021524  768234  54134123
2.3261
744034 6644034 75096 5302134 298978814 456456
6767294 70441234 330234 200135   867234  54004123
204203 22015 120158 125 21  625 11 5 2.021

или, может быть, один из них (или что-то еще - скажите ....):

$ awk -v RS= -v ORS='\n\n' '!(NR%2)' file
234034 6361234 45096 12342134 2878814 456456
125294 7341234 17234 23135   768234  54134123
213203 6.25 2.36 1.0 0.0021

298034 20481234 45096 12502134 2870814 456456
19875294 441284 98234 27897135 251021524  768234  54134123
2.3261

744034 6644034 75096 5302134 298978814 456456
6767294 70441234 330234 200135   867234  54004123
204203 22015 120158 125 21  625 11 5 2.021

.

$ awk -v RS= -v OFS='\n' '!(NR%2){$1=$1; print}' file
234034
6361234
45096
12342134
2878814
456456
125294
7341234
17234
23135
768234
54134123
213203
6.25
2.36
1.0
0.0021
298034
20481234
45096
12502134
2870814
456456
19875294
441284
98234
27897135
251021524
768234
54134123
2.3261
744034
6644034
75096
5302134
298978814
456456
6767294
70441234
330234
200135
867234
54004123
204203
22015
120158
125
21
625
11
5
2.021

Answer 2

Если я правильно понял, это может помочь:

>>> [np.array(block.split()).astype(float)  # good blocks get parsed into np arrays
     for block in file_content.split("\n\n")  # split by empty lines
     if not block[0].isalpha()]  # avoid string lines                                                                                   

[array([2.3403400e+05, 6.3612340e+06, 4.5096000e+04, 1.2342134e+07,
        2.8788140e+06, 4.5645600e+05, 1.2529400e+05, 7.3412340e+06,
        1.7234000e+04, 2.3135000e+04, 7.6823400e+05, 5.4134123e+07,
        2.1320300e+05, 6.2500000e+00, 2.3600000e+00, 1.0000000e+00,
        2.1000000e-03]),
 array([2.98034000e+05, 2.04812340e+07, 4.50960000e+04, 1.25021340e+07,
        2.87081400e+06, 4.56456000e+05, 1.98752940e+07, 4.41284000e+05,
        9.82340000e+04, 2.78971350e+07, 2.51021524e+08, 7.68234000e+05,
        5.41341230e+07, 2.32610000e+00]),
 array([7.44034000e+05, 6.64403400e+06, 7.50960000e+04, 5.30213400e+06,
        2.98978814e+08, 4.56456000e+05, 6.76729400e+06, 7.04412340e+07,
        3.30234000e+05, 2.00135000e+05, 8.67234000e+05, 5.40041230e+07,
        2.04203000e+05, 2.20150000e+04, 1.20158000e+05, 1.25000000e+02,
        2.10000000e+01, 6.25000000e+02, 1.10000000e+01, 5.00000000e+00,
        2.02100000e+00])]