Вы четко упомянули, что вам нужна boto3
версия, но вот рабочая версия cli. Это может дать вам некоторую подсказку.
aws s3api list-objects --bucket hello --prefix "is/it/me/your/looking/for" --query "reverse(sort_by(Contents,&Key))"
В вашем коде это может быть что-то вроде этого (извините, не знаком с python)
query = 'reverse(sort_by(Contents,&Key))'
for page in paginator.paginate(Bucket=bucket, Prefix=prefix, Query=query):