Вы не можете разместить свое приложение Node.js в IIS. Вы можете использовать IIS в качестве обратного прокси для вашего Node.js приложения.
Затем вы запустите ваше приложение Node.js на вашем Node.js и настроите IIS для маршрутизации запросов к вашему приложению Node.js, размещенному на Node.js.
Учебник для чего-то подобного можно найти здесь