Я пытался вычислить количество пикселей трех растровых файлов, которые удовлетворяют определенному условию с R (в Windows 10 и R версии 3.6.3). Идея состоит в том, чтобы использовать эти три изображения (которые предварительно обработаны) и подсчитать количество пикселей, которые удовлетворяют условию в выражении if
следующего кода.
library(rgdal)
library(raster)
mydir<- file.path("D:/files")
setwd(mydir)
listado1 <- list.files(pattern="crNDVI*")
listado2 <- list.files(pattern="crNBR*")
listado3 <- list.files(pattern="dNBR*")
df <- data.frame(NULL)
for (i in 1:length(listado1)) {
r1 <- raster(listado1[i])
v1 <- values(r1)
for (j in 1:length(listado2)) {
r2 <- raster(listado2[j])
v2 <- values(r2)
for (k in 1:length(listado3)) {
r3 <- raster(listado3[k])
v3 <- values(r3)
if ((i==j) & (j==k)){
df2 <- data.frame(NULL)
df2 <- data.frame(v1, v2, v3)
burn <- subset(df2, df2$v1 >= 0.3 & df2$v1 <= 1.0 & df2$v2 >= 0.2 & df2$v2 <= 1.3 & df2$v3 > 0.1 & df2$v3 <= 1.3)
burned_area <- nrow(burn)*(xres(r1)*yres(r1))*10^(-4) # Hectares
name <- paste(substr(listado1[i], 8, 15), sep="")
df <- rbind(df, data.frame(name,burned_area))
print(paste("iteracion:",i,j,k," ok",sep = " "))
}
else {
print(paste("iteracion:",i,j,k," passed",sep = " "))
invisible()}
}
}
}
write.csv(df,file = "burned_area.csv")
Как можно обратите внимание, у меня есть три типа предварительно обработанных растровых (*.tif
) файлов, которые начинаются с crNDVI
, crNBR
и dNBR
, все эти файлы перечислены в каждой переменной "listado
". Идея состоит в том, чтобы перебирать файлы каждого типа и получать значения каждого растрового файла в день. Код делает то, что должен (я получаю файл .csv
со сгоревшей областью (пиксели, которые удовлетворяют условию), однако вычисление занимает вечность, потому что каждый растровый файл соответствует определенному c дню и, следовательно, результат в burned_area
- это значение в день, поэтому единственная возможность для этого - когда i=j=k
, но, применяя последний код, итерация выполняется над каждой возможностью в for
l oop. Код запускается из i = 1, затем j = 1, а затем k = 1,2,3 ... до последнего файла listado3[k]
, а когда длина listado3[k]
заканчивается, он переходит к следующему индексу j+1
и зацикливает все снова и снова в k
для каждой (ненужной) итерации.
Может ли кто-нибудь помочь мне сделать то же самое более эффективным способом? Есть ли возможность навязать "только i=j=k
" для Целые вложенные циклы for
Буду очень признателен за любые советы. Заранее спасибо, Хорхе.
Примечание: все растровые файлы имеют одинаковый экстент, nrow
, ncol
и ncell
.